Koordinacijska geometrija

{glavni|Kompleksna spojina}}Izraz koordinacijska geometrija se uporablja na številnih sorodnih področjih kemije in kemije/fizike trdne snovi.

Molekule uredi

Glavni članek: Molekularna geometrija.

Koordinacijska geometrija molekul je geometrijska oblika, ki jo tvorijo atomi, vezani okrog centralnega atoma.

Anorganski koordinacijski kompleksi uredi

V anorganskih koordinacijskih kompeksih tvorijo geometrijske vzorce atomi ligandov, ki so vezani na centralni atom molekule. Geometrijska razporeditev atomov je odvisna od števila in vrste ligandov in koordinacijskih prioritet centralnega atoma, ki je običajno kovina. Število vezanih atomov, se pravi število σ-vezi med centralnim atomom in ligandi, je koordinacijsko število. Geometrijski vzorec se lahko prikaže kot polieder, katerega oglišča so središča koordiniranih atomov v ligandih.[1]

Koordinacijska prioriteta centralnega atoma se pogosto spreminja z njegovim oksidacijskim stanjem. Število koordiniranih vezi (koordinacijsko število) lahko variira od 2 do 20 v Th(η5-C5H5)4.[2]

Ena od najbolj pogostih koordinacijskih geometrij je oktaeder, v katerem je šest ligandov koordiniranih na kovino v simetrični porazdelitvi. Če se središča ligandov povežejo s črtami, dobi molekula obliko oktaedra. Drugi pogosti koordinacijski geometriji sta tetraedska in kvadratno planarna.

Za razlago relativnih stabilnosti spojin prehodnih kovin z različnimi koordinacijskimi geometrijami, pa za tudi prisotnost ali odsotnost paramagnetizma, se lahko uporabi teorijo kristalnega polja.

Za napovedovanje geometrije kompleksov elementov iz glavnih skupin periodnega sistema se lahko uporabi tudi teorijo o odboju valenčnih elektronskih parov.

Kristalografija uredi

Koordinacijska geometrija atomov v kristalni strukturi je geometrijski vzorec koordiniranih atomov, pri čemer je definicija koordiniranih atomov odvisna od uporabljenega modela.[1] V kuhinjski soli, na primer, je vsak natrijev atom obdan s po šestimi atomi klora v obliki oktaedra. V kovinskih kristalih s telesno centrirano kocko je vsak atom obdan z osmimi najbližjimi sosedi v obliki kocke. V kovinskih kristalih s ploskovno centrirano kocko je vsak atom obdan z dvanajstimi najbližjimi sosedi v kubično tetraedrski obliki.

Pregled geometrijskih oblik uredi

V preglednici so prikazane geometrijske oblike in primeri kompleksov, v katerih se te oblike pojavljajo. V nediskretnih kompleksih so spojine in koordinacijske sfere prikazane v diskretnih enotah.

Koordinacijsko številoOblikaPrimeri diskretnih (končnih) kompleksovPrimeri v kristalih
2linearna Ag(CN)2 v KAg(CN)2[3]Ag v srebrovem cianidu,
Au v AuI[2]
3trigonalno planarna Cu(CN)32− v
Na2Cu(CN)3.3H2O[2]
O v TiO2 (rutil)[3]
4tetragonalna CoCl42−[2]Zn in S v cinkovem sulfidu, Si v silicijevem dioksidu[3]
4kvadratno planarna AgF4[2]bakrov(II) oksid (CuO)[3]
5trigonalno bipiramidalna SnCl5[3]
5kvadratno piramidalna InCl52− v (NEt4)2InCl5[2]
6oktagonalna Fe(H2O)62+[2]Na in Cl v NaCl[3]
6trigonalno prizmatičnaMo(SCHCHS)3[3]As v nikljevem arzenidu (NiAs), Mo v molibdenovem disulfidu (MoS2)[3]
7pentagonalno bipiramidalna ZrF73− v (NH4)3ZrF7[3]Pa v protaktinijevem(V) kloridu (PaCl5)
7face capped octahedral[HoIII(PhCOCHCOPh)3(H2O)][4]La v lantanovem(III) oksidu (A-La2O3)
7trigonalno prizmatična, square face monocappedTaF72− v K2TaF7[3]
8kubičnacezijev klorid (CsCl), kalcijev klorid (CaCl2)
8kvadratno antiprizmatična TaF83− in Na3TaF8[3]torijev(IV) jodid (ThI4)[3]
8dodekaedrska (pravilen naziv je bisdifenoidna, ker gre za deltaeder) Mo(CN)84− v K4[Mo(CN)8].2H2O[3]Zr in K2ZrF6[3]
8heksagonalno bipiramidalna N v litijevem nitridu (Li3N)[3]
8oktagonalna, trans-dvokapnaNi v nikljevem arzenidu (NiAs); 6 As sosedov + 2 Ni na vrhu[5]
8trigonalno prizmatična, triangular face bicappedCa in CaFe2O4[3]
8trigonalno prizmatična, square face bicappedPuBr3[3]
9trigonalno prizmatična, square face tricapped [ReH9]2− v kalijevem nonahidrorenatu[2]SrCl2.6H2O , Th v RbTh3F13[3]
9enokapno kvadratno antiprizmatična[Th(tropolonate)4(H2O)][2]La in LaTe2[3]
10dvokapno kvadratno antiprizmatičnaTh(C2O4)42− [2]
11Th v [ThIV(NO3)4(H2O)3] (NO3 je bidentat) [2]
12ikozaedrska Th v Th(NO3)62− ion v Mg[Th(NO3)6].8H2O [3]
12kuboktagonalna ZrIV3−(BH4)4)atomi v kovinah s ploskovno centrirano kocko, na primer Ca[3]
12antikoboktaedrska, triangular orthobicupola atomi v kompaktnih heksagonalnih skladih kovin, na primer Sc [3]
14dvokapno heksagonalno antiprizmatičnaU(BH4)4[2]

Poimenovanje anorganskih spojin uredi

IUPAC je v svojem priporočilu za nomenklaturo anorganskih spojin leta 2005 uvedel poliedrski simbol,[6] ki opisuje geometrijo okrog centralnega atoma v spojini.

IUCr je predlagal simbol, ki je v kemijski formuli zapisan kot eksponent v oglatih oklepajih. Primer: CaF2 se zapiše kot Ca[8cb]F2[4t]. Zapis [8cb] pomeni kubično koordinacijo, [4t] pa tetraeder. Enakovredna zapisa IUPAC sta CU-8 in T-4.[6] IUPACovi simboli so primerni za kompleksne spojine in molekule, IUCrjevi pa za kristalinične trdne snovi.

Sklici uredi

  1. 1,0 1,1 J. Lima DeFaria, E. Hellner, F. Liebau, E. Makovicky, E. Parthé (1989): Report of the International Union of Crystallography Commission on Crystallographic Nomenclature Subcommittee on the Nomenclature of Inorganic Structure Types [1] Arhivirano 2012-06-13 na Wayback Machine.
  2. 2,00 2,01 2,02 2,03 2,04 2,05 2,06 2,07 2,08 2,09 2,10 2,11 N.N. Greenwood; A. Earnshaw (1997). Chemistry of the Elements (2 izd.). Oxford [etc.] : Butterworth Heinemann. COBISS 18882053. ISBN 0-7506-3365-4.
  3. 3,00 3,01 3,02 3,03 3,04 3,05 3,06 3,07 3,08 3,09 3,10 3,11 3,12 3,13 3,14 3,15 3,16 3,17 3,18 3,19 3,20 3,21 A.F. Wells (1984). Structural Inorganic Chemistry (5 izd.). Oxford: Clarendon Press. COBISS 621359. ISBN 0-19-855370-6.
  4. Crystal and molecular structure of the heptacoordinate complex tris(diphenylpropanedionato)aquoholmium, Ho(PhCOCHCOPh)3.H2O, Zalkin A., Templeton D.H., Karraker D.G, Inorganic chemistry, 1969, 8, 12,2680-2684.
  5. David G. Pettifor, Bonding and Structure of Molecules and Solids, 1995, Oxford University Press,ISBN 0198517866
  6. 6,0 6,1 Nomenclature of Inorganic Chemistry IUPAC Recommentations 2005, ed. N. G. Connelly et al. RSC Publishing http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/bioinorg/